Es gibt zahlreiche Unterschiede zwischen den beiden Fledertierarten, aber hier sind die wichtigsten übersichtlich zusammengefasst:
Fledermäuse sind eher kleine Tiere. Auch ihre Augen sind klein. Da sie zur Orientierung Echoortung benutzen, müssen diese auch nicht größer sein oder gut sehen können. Fledermäuse fressen vor allem Insekten.
Flughunde sind eher große Tiere. Sie haben große Augen, mit denen sie gut sehen können. Nur wenige Flughundarten verwenden die Echoortung. Flughunde ernähren sich weniger von Insekten, sondern vor allem von Früchten, Nektar und Pollen.